Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms