Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms