Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP8P40818 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP8P40818 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP8P40818 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP8P40818 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP8P40818 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms