Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms