Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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