Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCAP28676 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms