Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms