Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PLNP26678 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PLNP26678 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms