Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms