Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDSP20132 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDSP20132 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDSP20132 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDSP20132 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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