Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms