Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD58P19256 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD58P19256 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD58P19256 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms