Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB1P16220 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms