Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCF4P15884 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCF4P15884 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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