Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms