Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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