Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TGFB1P01137 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TGFB1P01137 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TGFB1P01137 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TGFB1P01137 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TGFB1P01137 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TGFB1P01137 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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