Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms