Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms