Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms