Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TXNDC9O14530 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms