Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms