Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCC2H7BZ55 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms