Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

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Length 811 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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