Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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