Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms