Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms