Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms