Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms