Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PHF8Q9UPP1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF8Q9UPP1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms