Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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