Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCM2LQ9NUG4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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