Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms