Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms