Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms