Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCSER1Q9C0I3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCSER1Q9C0I3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCSER1Q9C0I3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCSER1Q9C0I3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCSER1Q9C0I3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCSER1Q9C0I3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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