Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CNTNAP3Q9BZ76 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTNAP3Q9BZ76 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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