Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms