Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms