Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms