Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT61BQ9BVS5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms