Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms