Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms