Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms