Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSEN34Q9BSV6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms