Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms