Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms