Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PKP4Q99569 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PKP4Q99569 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PKP4Q99569 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PKP4Q99569 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PKP4Q99569 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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