Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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