Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms